Através de um convênio com a Universidade do Estado do Rio de Janeiro (Uerj), o Programa Nova Baixada está promovendo a integração dos alunos da universidade às creches construídas pelo governo do Estado em Duque de Caxias, Belford Roxo, Mesquita e São João de Meriti, na Baixada Fluminense. Os alunos do curso de nutrição da Uerj vão transmitir o conhecimento adquirido aos funcionários responsáveis pela produção de refeições para as crianças dessas creches. O intercâmbio começa pelas creches de Duque de Caxias.
O Programa Nova Baixada quer melhorar a utilização dos alimentos, oferecendo um cardápio balanceado, com aproveitamento total dos nutrientes para todas as crianças.
Para melhorar o atendimento nos Módulos de Saúde, o Programa Nova Baixada vai levar universitários da Uerj para desenvolver um trabalho conjunto com os agentes de saúde da comunidade e com as equipes do Programa de Saúde da Família.
Também participam dessa integração com a Uerj a Gerência de Geração Trabalho e Renda do Programa Nova Baixada. Os universitários, de diversas áreas, vão acompanhar os cursos profissionalizantes oferecidos pelo programa, dando apoio didático e esclarecendo dúvidas dos alunos.
O Nova Baixada está atuando também com a Faculdade de Educação da Uerj, que vai avaliar a qualidade de todos os serviços prestados pelas creches construídas pelo programa na Baixada Fluminense. Através de uma pesquisa, será elaborado um diagnóstico mostrando os pontos positivos da metodologia desenvolvida nas creches e, caso sejam detectadas falhas, o programa deverá fazer as correções.