A temporada de 2011 chegou ao fim para a Inter de Bebedouro com a eliminação na segunda fase da Copa Paulista de Futebol. Apesar da boa campanha na primeira fase, a equipe de Bebedouro não conseguiu manter o desempenho na segunda e acabou terminando na terceira colocação do Grupo 05.
Apesar da eliminação, o treinador Leston Júnior aprovou a participação de seu time. “O campeonato foi muito proveitoso. Os meninos foram vitoriosos em campo e a Inter evoluiu muito nesse período. Agora é planejar 2012”.
O bom segundo semestre da equipe de Bebedouro em nada se pareceu com o início do ano. Na disputa do Campeonato Paulista da Série A3, a Inter escapou do rebaixamento apenas na última rodada da primeira fase.