O Município enviou ofício ao Ministério da Saúde solicitando providências para que, até o final do ano, o governo federal normalize o pagamento de suas obrigações relativas a 23 unidades de saúde municipalizadas em 1999 e 2000, conforme previsto no acordo. Sem o recebimento dos recursos necessários e com o acolhimento de milhares de pacientes que não encontram atendimento adequado em unidades de saúde das redes federal, estadual e dos municípios fluminenses, a Prefeitura do Rio vem enfrentando dificuldades para manter a qualidade dos seus serviços hospitalares e ambulatoriais.
Os recursos que não vém sendo repassados se referem a despesa de pessoal, manutenção e aquisição de equipamentos, além do custeio de obras. Essas despesas não fazem parte dos convênios que concederam ao Município a responsabilidade gerencial sobre 15 Postos de Assistência Médica (PAMs) e oito hospitais federais. Se o Ministério não normalizar os pagamentos devidos, o Município poderá devolver a responsabilidade gerencial de todas as unidades ao governo federal.