Dezenas de milhares de pessoas participavam da homenagem, na maior concentração de pessoas organizada pelo Fatah em Gaza, desde o conflito armado em que o grupo perdeu o controle militar do território para o Hamas, em junho.
A multidão entrou em pânico por causa dos tiros e muitos tentaram fugir. Cerca de cem pessoas teriam ficado feridas.
A confusão começou no final da cerimônia, quando simpatizantes do Fatah começaram a gritar frases de provocação aos membros do Hamas.
Eles também teriam atirado pedras contra as forças da segurança do Hamas, que responderam com tiros para o alto, além de agressões e prisões de membros do Fatah.
O Hamas acusou os simpatizantes do Fatah de também abrir fogo, mas segundo um correspondente da BBC, não há provas que confirmem a informação.
Yasser Arafat, que foi presidente da Autoridade Palestina e líder do Fatah, morreu em 2004, em um hospital militar de Paris.
Desde sua morte, a política palestina tem sido marcada por divisões, as mais violentas entre o grupo secular nacionalista Fatah e o grupo radical islâmico Hamas.